祝由，明代之前，在官方医院中设立的最后的一个科室，即祝由科。
　　最后的一个科室，就是第十三科，所以习惯上称作祝由十三科。其实，应该称作十三科祝由。
　　祝由科治病不需要药物、针灸、手术，而是主治医生根据病情，或按照北斗七星的排列位置行转脚踏（禹步），或默颂咒语，或采用朱砂绘制符箓，借此与天地间的某类有可能相关的未知力量沟通，了解疾病的缘由，从而达到移精变气，阻断病痛。
　　但是，若疾病不属于鬼怪作祟，祝由无效，必须利用医药治疗。
　　明·虞抟《医学正传》：“禁咒科者，即《素问》祝由科也。立教于龙树居士，为移精变气之术耳，可治小病。或男女入神庙惊惑成病，或山林溪谷冲著恶气，其證如醉如痴，此为邪鬼所附，一切心神惶惑之證，可以借咒语以解惑，安和而已。古有龙树咒法之书行于世，今流而为师巫，为降童，为师婆，而为扇惑人民哄吓取财之术。噫！邪术为邪人用之，知理者勿用也。”
　　所谓祝：具有双重含义。第一，即咒（呪），音zhòu，祷告、诅咒（神鬼）之义。《康熙字典》释：“以言吿神谓之祝。请神加殃谓之诅。”但此处仍读作zhù；第二，阻断、断绝（疾病）之义。
　　所谓由：具有双重含义。第一，（疾病的）来由、原因；第二，（鬼神）遵循、听从。
　　《明史·太医院》记载：“太医院。院使一人，正五品院判二人。正六品其属，御医四人，正八品，后增至十八人，隆庆五年定设十人。生药库、惠民药局，各大使一人，副使一人。
　　太医院掌医疗之法。凡医术十三科，医官、医生、医士，专科肄业曰大方脉（内科）、曰小方脉（儿科）、曰妇人、曰疮疡、曰针灸、曰眼、曰口齿、曰接骨、曰伤寒、曰咽喉、曰金镞、曰按摩、曰祝由。”
　　所谓移精变气，古代中医治疗学术语。是指转移病人思维、改变脏腑气机紊乱，从而达到治愈疾病的方法。
　　清代医学家张志聪解释道：“移精变气者，移益其精，传变其气也。对神之辞，曰祝；由，从也，言通祝于神明，病从而可愈也。”
　　唐·孙思邈《千金翼方·禁经》曰：“千卷未尽其性，故有汤药焉、有针灸焉、有禁咒焉、有符印焉、有导引焉，斯之五法，皆救急之术也……但按法施行，功效出于意表，不有所缉，将恐零落。今编为两卷，凡二十二篇，名曰<禁经>。其于条例，后科详悉。博雅君子，无或隐焉。”

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